Wissenschaftlichen Mitarbeiterin*Datenanalyse / Bioinformatik (m-w-d) (Bioinformatiker/in)
Wissen schaffen. Seit 1502: Die Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg (MLU) bietet ein breites Spektrum an akademischen Fächern in den Bereichen Geistes- und Sozialwissenschaften, Naturwissenschaften und Medizin. Die älteste und größte Universität Sachsen-Anhalts entstand 1817 durch den Zusammenschluss der Universität Wittenberg (gegründet 1502) mit der Friedrichs-Universität Halle (gegründet 1694). Heute hat die Universität 340 Professoren und 20.000 Studenten. Die Forschungsschwerpunkte der Universität liegen in den Bereichen Nano- und Lebenswissenschaften, Aufklärung, Gesellschaft und Kultur. An der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Medizinische Fakultät, Universitätsklinik und Poliklinik für Innere Medizin I, ist ab dem nächstmöglichen Zeitpunkt die auf bis zu 3 Jahre befristete Stelle einer*eines Wissenschaftlichen Mitarbeiters*in – Datenanalyse / Bioinformatik (m-w-d) in Vollzeit zu besetzen. Die Vergütung erfolgt je nach Aufgabenübertragung und Erfüllung der persönlichen Voraussetzungen bis zur Entgeltgruppe 13 TV-L. Unsere Arbeitsgruppe verfolgt das Ziel, personalisierte Prävention, Diagnose und Behandlung von Bauchspeicheldrüsenkrebs durch die Analyse von Patientenproben (Pankreas, Fettgewebe, Blut) mittels Single-Cell- und Spatial-Transcriptomics zu verbessern. Diese hochdimensionalen Analysen werden durch funktionelle Studien mit ex vivo Organoid-, Primärzell- und in vivo Mausmodellen ergänzt. Die Arbeit ist in das Pankreaszentrum Halle, das DFG-geförderte GRK2751 und das EFRE-mikroPank-Konsortium integriert. Unser Bioinformatik-Team betreut die gesamte Pipeline von der Datengenerierung bis zur klinischen Anwendung.
Arbeitsaufgaben:
- Konzeption und Planung von Experimenten und Datenanalysen •
- Analyse von Next Generation Sequencing (NGS)-, Einzelzellsequenzierungs (scRNA-seq / snRNA-seq) und räumlichen Transkriptomik (spatial transcriptomics) Daten •
- Auswertung und Dokumentation der Forschungsergebnisse •
- Schreiben von R- und / oder Python-Skripten •
- Entwicklung und Optimierung von Analyse Workflows •
- Etablierung neuer Daten-Analyse-Methoden •
- Projektleitung •
- Beteiligung an nationalen und internationalen Kooperationen •
- Vorträge, Seminare •
- Verfassen von begutachteten (peer reviewed) Publikationen und Anträgen •
- Betreuung von Bachelor-, Master- und PhD Studierenden •
- Mitwirkung an Workshops und Lehrveranstaltungen gemäß LVVO •
- Möglichkeit zur eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung ist gegeben – Habilitation
Voraussetzungen:
- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master, Diplom) in einem Fach der Biowissenschaften wie Bioinformatik, Biologie, Biochemie, Humanmedizin oder einer vergleichbaren Fachrichtung •
- Erfolgreich abgeschlossene Promotion (PhD, Dr. rer. nat., Dr. med. oder vergleichbar) •
- Fortgeschrittene Kenntnisse in R und / oder Python •
- Umfassende Kenntnisse und mehrjährige Erfahrungen in der Analyse von NGS-, scRNA-seq- und/oder räumlichen Transkriptomikdaten, mathematischer Modellierung dynamischer biologischer Prozesse und statistischer Analyse biomedizinischer Fragestellungen •
- Sicherer Umgang mit Linux Umgebungen •
- Mehrjährige Erfahrung in der Erforschung menschlicher Krankheiten, vorzugsweise Pankreaskrebs- und / oder Adipositas-Forschung •
- Starkes Interesse an translationaler Krebsforschung •
- Erfahrung bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen und Drittmittelanträge •
- Erfahrung in der Lehre •
- Sehr gute Deutschkenntnisse in Wort und Schrift •
- Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift •
- Sehr gute didaktische Fähigkeiten •
- Analytisches und problemorientiertes Denken •
- Strukturierte und sorgfältige Arbeitsweise •
- Fähigkeit zur Arbeit in einem interdisziplinären Team
Wir bieten:
- Enge Zusammenarbeit mit experimentellen Gruppen, Kliniker*innen in den Konsortien IncuPanc / mikro- Pank, •
- Zugang zu hochwertigen, Patienten und Tiermodel Multi-Omics-Datensätzen und zu Biobank Material, •
- interessante und abwechslungsreiche Tätigkeiten mit Gestaltungsspielraum bei der größten Arbeitgeberin der Region, •
- die Möglichkeit, mit Ihrer Tätigkeit die Bildung junger Menschen zu unterstützen und dazu beizutragen, dass neue Erkenntnisse gewonnen und wichtige wissenschaftliche Forschungsfragen beantwortet werden können, •
- eine Beschäftigung im öffentlichen Dienst, Vergütung gem. Tarifvertrag der Länder (TV-L) einschließlich einer Jahressonderzahlung und einer betrieblichen Altersvorsorge, •
- einen sicheren Arbeitsplatz und attraktive Arbeitsbedingungen (Homeoffice, flexible Arbeitszeitgestaltung, variable Teilzeitmodelle), •
- 30 Tage Erholungsurlaub im Jahr, zusätzlich arbeitsfrei am 24. und 31. Dezember, •
- eine weltoffene, vielfältige und internationale Arbeitsumgebung, die auch als familiengerecht zertifiziert ist (incl. Ferienbetreuung), •
- umfassende Personalentwicklung in allen Phasen des Berufslebens mit vielfältigen Weiterbildungs- und Qualifizierungsmöglichkeiten einschließlich Bildungsurlaub, •
- Angebote zur Förderung und Erhaltung Ihrer Gesundheit im Rahmen unseres Gesundheitsmanagements sowie vielfältige Angebote im Hochschulsport, •
- die Möglichkeit der Teilhabe an vielfältigen sozialen Gemeinschaften (u. a. Universitätssportteams, Universitätschor oder Universitätsorchester) und der Teilnahme an spannenden Veranstaltungen, z. B. Lange Nacht der Wissenschaften, Hochschulinformationstag, Winterball der Universität, •
- vergünstigte Speisenversorgung in den Mensen des Studentenwerks Halle.